Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms