Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms