Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ddx60E9PZQ1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ddx60E9PZQ1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ddx60E9PZQ1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ddx60E9PZQ1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ddx60E9PZQ1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ddx60E9PZQ1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Ddx60E9PZQ1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ddx60E9PZQ1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Ddx60E9PZQ1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ddx60E9PZQ1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Ddx60E9PZQ1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Ddx60E9PZQ1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ddx60E9PZQ1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Ddx60E9PZQ1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Ddx60E9PZQ1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Ddx60E9PZQ1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Ddx60E9PZQ1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Ddx60E9PZQ1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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Ddx60E9PZQ1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddx60E9PZQ1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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