Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gcom1E9PZ54 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms