Protein–RNA interactions for Protein: E9PXM3

Vmn1r177, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r177E9PXM3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms