Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc62E9PVD1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms