Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FgaE9PV24 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms