Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms