Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl3E0CZ16 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms