Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rdh8D3Z6W3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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