Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms