Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms