Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms