Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc8D3YZV8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms