Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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BC048679D3YXE9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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BC048679D3YXE9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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BC048679D3YXE9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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BC048679D3YXE9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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BC048679D3YXE9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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BC048679D3YXE9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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BC048679D3YXE9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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BC048679D3YXE9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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BC048679D3YXE9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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BC048679D3YXE9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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BC048679D3YXE9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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BC048679D3YXE9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BC048679D3YXE9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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