Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kpna7C0LLJ0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms