Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smok3bC0HKC9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms