Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Siah3B2RWG3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms