Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms