Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms