Protein–RNA interactions for Protein: B1B0V2

AU022751, Expressed sequence AU022751, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU022751B1B0V2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AU022751B1B0V2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AU022751B1B0V2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AU022751B1B0V2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AU022751B1B0V2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AU022751B1B0V2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AU022751B1B0V2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AU022751B1B0V2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AU022751B1B0V2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AU022751B1B0V2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AU022751B1B0V2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AU022751B1B0V2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AU022751B1B0V2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AU022751B1B0V2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AU022751B1B0V2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AU022751B1B0V2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AU022751B1B0V2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AU022751B1B0V2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AU022751B1B0V2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AU022751B1B0V2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AU022751B1B0V2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AU022751B1B0V2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AU022751B1B0V2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AU022751B1B0V2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms