Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms