Protein–RNA interactions for Protein: B1AWN9

Tnfrsf25, Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 25, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf25B1AWN9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfrsf25B1AWN9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms