Protein–RNA interactions for Protein: B1AW18

4930402K13Rik, MCG54973, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930402K13RikB1AW18 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930402K13RikB1AW18 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms