Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trabd2bB1ATG9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.04■□□□□ -0
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Trabd2bB1ATG9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Trabd2bB1ATG9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Trabd2bB1ATG9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Trabd2bB1ATG9 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.03■□□□□ -0
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Trabd2bB1ATG9 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.03■□□□□ -0
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Trabd2bB1ATG9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Trabd2bB1ATG9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trabd2bB1ATG9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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