Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms