Protein–RNA interactions for Protein: A7XUY5

Skint5, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint5A7XUY5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Skint5A7XUY5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Skint5A7XUY5 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Skint5A7XUY5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Skint5A7XUY5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Skint5A7XUY5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Skint5A7XUY5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Skint5A7XUY5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Skint5A7XUY5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Skint5A7XUY5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Skint5A7XUY5 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skint5A7XUY5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skint5A7XUY5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skint5A7XUY5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skint5A7XUY5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skint5A7XUY5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skint5A7XUY5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skint5A7XUY5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skint5A7XUY5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skint5A7XUY5 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Skint5A7XUY5 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Skint5A7XUY5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skint5A7XUY5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skint5A7XUY5 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skint5A7XUY5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skint5A7XUY5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skint5A7XUY5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skint5A7XUY5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skint5A7XUY5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skint5A7XUY5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skint5A7XUY5 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skint5A7XUY5 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skint5A7XUY5 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skint5A7XUY5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skint5A7XUY5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skint5A7XUY5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skint5A7XUY5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skint5A7XUY5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Skint5A7XUY5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skint5A7XUY5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skint5A7XUY5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skint5A7XUY5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms