Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3173A6NAS3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms