Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp4A4UUI3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms