Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Atp8b5A3FIN4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Atp8b5A3FIN4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
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Atp8b5A3FIN4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Atp8b5A3FIN4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Atp8b5A3FIN4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
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Atp8b5A3FIN4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp8b5A3FIN4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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