Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r232A2RTT5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms