Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Rnf39A2RT81 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Rnf39A2RT81 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Rnf39A2RT81 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Rnf39A2RT81 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Rnf39A2RT81 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf39A2RT81 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf39A2RT81 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf39A2RT81 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf39A2RT81 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf39A2RT81 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Rnf39A2RT81 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rnf39A2RT81 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rnf39A2RT81 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf39A2RT81 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf39A2RT81 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf39A2RT81 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rnf39A2RT81 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf39A2RT81 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf39A2RT81 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf39A2RT81 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf39A2RT81 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf39A2RT81 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf39A2RT81 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf39A2RT81 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rnf39A2RT81 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf39A2RT81 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rnf39A2RT81 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rnf39A2RT81 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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