Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms