Protein–RNA interactions for Protein: A2ACP1

Ttc39a, Tetratricopeptide repeat protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39aA2ACP1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc39aA2ACP1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ttc39aA2ACP1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ttc39aA2ACP1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ttc39aA2ACP1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ttc39aA2ACP1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms