Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc173A0JLY1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms