Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDB2

4930469K13Rik, RIKEN cDNA 4930469K13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930469K13RikA0A286YDB2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms