Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPC5

Zfp109, Zinc finger protein 109, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp109A0A0U1RPC5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zfp109A0A0U1RPC5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms