Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A0A0U1RNP2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms