Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC-0.6□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.5
SMG1Q96Q15 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
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