Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.07
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SIX1Q15475 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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SIX1Q15475 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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SIX1Q15475 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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SIX1Q15475 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SIX1Q15475 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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