Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
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