Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ALCAMQ13740 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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