Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATRQ13535 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATRQ13535 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATRQ13535 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATRQ13535 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATRQ13535 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC-0.03□□□□□ -2.42
ATRQ13535 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATRQ13535 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATRQ13535 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATRQ13535 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATRQ13535 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATRQ13535 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATRQ13535 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATRQ13535 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATRQ13535 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATRQ13535 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATRQ13535 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATRQ13535 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATRQ13535 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATRQ13535 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATRQ13535 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATRQ13535 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATRQ13535 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATRQ13535 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATRQ13535 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATRQ13535 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATRQ13535 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATRQ13535 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATRQ13535 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATRQ13535 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATRQ13535 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATRQ13535 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATRQ13535 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATRQ13535 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATRQ13535 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATRQ13535 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATRQ13535 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATRQ13535 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATRQ13535 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATRQ13535 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATRQ13535 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATRQ13535 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATRQ13535 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATRQ13535 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATRQ13535 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATRQ13535 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATRQ13535 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATRQ13535 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATRQ13535 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATRQ13535 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATRQ13535 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATRQ13535 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATRQ13535 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATRQ13535 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATRQ13535 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATRQ13535 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATRQ13535 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATRQ13535 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATRQ13535 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATRQ13535 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATRQ13535 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATRQ13535 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATRQ13535 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATRQ13535 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATRQ13535 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATRQ13535 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATRQ13535 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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