Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
BNIP3Q12983 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.5 ms