Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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RPE65Q16518 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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RPE65Q16518 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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RPE65Q16518 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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