Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
CTTNQ14247 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CTTNQ14247 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms