Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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PDE6HQ13956 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
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PDE6HQ13956 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
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PDE6HQ13956 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
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PDE6HQ13956 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
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PDE6HQ13956 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
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PDE6HQ13956 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
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PDE6HQ13956 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
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PDE6HQ13956 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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