Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC0.12□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC0.12□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.12□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms