Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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