Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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